“Scienze Cliniche e Traslazionali”, Curriculum in “Immunologia e Microbiologia”

Referente per le discipline microbiologiche: Prof.ssa Giovanna Batoni

Il corso di Dottorato in “Scienze cliniche e traslazionali” dell’Università di Pisa ha come obiettivo principale la formazione di ricercatori nel settore delle Scienze Biomediche fornendo loro una solida cultura scientifica e padronanza nelle tecnologie e metodologie d’avanguardia, favorendo l’integrazione e la collaborazione multidisciplinare. Il corso di Dottorato si organizza in diversi curricula, uno dei quali a indirizzo più prettamente microbiologico: il curriculum in “Immunologia e Microbiologia”.

La Sezione di Microbiologia si situa su due sedi principali, la sede di Via S. Zeno, 37 ed il Centro Retrovirus di Via del Brennero, 2. I dottorandi hanno inoltre accesso ai laboratori di diagnostica situati presso l’Azienda Ospedaliero-Universitaria Pisana, Presidio di Cisanello, per approfondire specifici aspetti dei loro progetti di ricerca. Tutte le sedi sono dotate di studi e laboratori attrezzati con moderne strumentazioni per effettuare ricerca in ambito microbiologico ad alto livello (ad es. cappe a flusso laminare, incubatori, sequenziatori, apparecchi per amplificazione genica, tradizionali e “real-time” (PCR quantitativa), MALDI-TOF, citofluorimetri, apparecchiature per acquisizione ed elaborazione immagini, elettroporatori, apparati per corsa elettroforetica mono e bidimensionale, microscopi, lettori per micropiastre, centrifughe e ultracentrifughe). Tutti i poli sopracitati sono dotati di laboratori di Biosicurezza di livello 3 per la propagazione di microrganismi altamente patogeni aereo-trasmessi e per la preparazione di vettori retrovirali e lentivirali.

Le linee di ricerca in ambito microbiologico sono molteplici ed includono:

• Immunità anti-infettiva e studio dei rapporti ospite-parassita nelle infezioni virali, batteriche e fungine;
• Studio dei fattori di virulenza e dei determinanti di patogenicità di microrganismi patogeni con particolare riguardo ai generi Mycobacterium, Bacillus,Pseudomonas, Candida ecc;
• Identificazione e sviluppo di nuove molecole ad attività antimicrobica e/o adiuvanti alternativi agli antibiotici convenzionali e di nuovi sistemi di delivery;
• I biofilm microbici e le infezioni ad esse correlate;
• Genotipizzazione ed epidemiologia molecolare di Mycobacterium tuberculosis e di micobatteri non tubercolari;
• Caratterizzazione di batteri probiotici ed analisi del loro comportamento nel tratto gastrointestinale;
• Impiego di probiotici quali agenti batterioterapici per la prevenzione/trattamento di infezioni multiresistenti;
• Allestimento e validazione di tecniche diagnostiche rapide per l’identificazione di batteri, funghi e virus patogeni per l’uomo;
• Studio dei meccanismi di neuropatogenesi virale;
• Identificazione di fattori cellulari e/o virali per la diagnosi precoce di danni neuronali da virus Zika;
• Studio dell’autofagia e del metabolismo lipidico in relazione all’infezione in vitro da virus erpetici e da arbovirus;
• Analisi in vitro e in vivo di candidati antivirali diretti contro l’ospite nel contrastare l’infezione da arbovirus, enterovirus e virus herpes simplex;
• Analisi del batterioma/viroma umano in relazione allo stadio di salute e malattia dell’uomo;
• Impiego di Anellovirus quali marcatori predittivi della funzionalità del sistema immunitario;
• Nuove strategie di gene editing e di delivery con vettori virali per la eliminazione di cellule tumorali;
• Sviluppo di sistemi di delivery e generazione di fattore VIII ricombinante a lunga emivita ed elevata attività coagulante.