Il modello murino è ampiamente utilizzato per gli studi sul microbioma intestinale (GM). Un recente studio pubblicato su Nature Communications descrive la costruzione di una nuova biobanca di specie microbiche chiamata, appunto, “mouse gut microbial biobank” (mGMB). La biobanca contiene 126 specie, rappresentate da 244 ceppi che sono stati depositati nella China General Microorganism Culture Collection. I ricercatori hanno sequenziato e caratterizzato fenotipicamente 77 nuove specie e ne hanno proposto la nomenclatura. La mGMB comprende anche specie che sono significativamente arricchite in campioni di cieco di topo sia C57BL/6J wild-type che ob/ob. I genomi delle 126 specie nella mGMB coprono il 52% dei geni non ridondanti del metagenoma murino (identità di sequenza ≥ 60%) e rappresentano il 93-95% delle funzioni annotate nel database KEGG-Orthology per quanto riguarda i modelli murini.
Questi dati ampliano la caratterizzazione tassonomica dei microbiomi intestinali (GM) di topo e rappresentano una risorsa utile per gli studi sulle interazioni ospite-microbo e sulle funzioni del microbioma intestinale.
Per maggiori informazioni
http://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-13836-5
Fonte:
Liu C, Zhou N, Du MX, et al. The Mouse Gut Microbial Biobank expands the coverage of cultured bacteria. Nat Commun. 2020;11(1):79. Published 2020 Jan 7. doi:10.1038/s41467-019-13836-5